Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms