Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms