Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms