Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC117Q8IWD4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms