Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms