Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms