Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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