Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms