Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGAP9Q5VTM2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms