Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP170Q5SW79 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms