Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms