Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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RTL8BQ17RB0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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RTL8BQ17RB0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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RTL8BQ17RB0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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RTL8BQ17RB0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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RTL8BQ17RB0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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