Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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