Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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