Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CARTPTQ16568 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms