Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms