Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DDB1Q16531 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDB1Q16531 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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