Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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