Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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