Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NPTX1Q15818 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NPTX1Q15818 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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