Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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NCOA1Q15788 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCOA1Q15788 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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