Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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