Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCEA2Q15560 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCEA2Q15560 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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