Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms