Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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