Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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