Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CDK5R1Q15078 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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