Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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