Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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