Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COL19A1Q14993 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms