Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CKAP5Q14008 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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