Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK13Q14004 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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