Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FHL3Q13643 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms