Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IKZF1Q13422 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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