Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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