Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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