Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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