Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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