Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TROQ12816 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TROQ12816 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TROQ12816 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TROQ12816 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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