Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGNL1Q0VF96 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms