Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms