Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms