Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms