Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms