Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4BQ07343 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms