Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms