Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms