Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLOD1Q02809 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms