Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DSG1Q02413 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DSG1Q02413 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms