Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POU5F1Q01860 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU5F1Q01860 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms